17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2411 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2411  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  952    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0411768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2394  hypothetical protein  35.07 
 
 		 353 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253182  normal  0.0390211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2393  hypothetical protein  34.66 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155273  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4779  hypothetical protein  33.82 
 
 		 425 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.570953  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0655  Pericardin like protein  37.16 
 
 		 684 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.541208  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  34 
 
 		 2272 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  35.48 
 
 		 2179 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0854  hypothetical protein  39.55 
 
 		 500 aa  53.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  34.24 
 
 		 971 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  30.71 
 
 		 491 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  43.42 
 
 		 533 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  30 
 
 		 497 aa  50.1  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  30.73 
 
 		 522 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  31.25 
 
 		 2136 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  33.71 
 
 		 490 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  35.38 
 
 		 1482 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1158  repeat of unknown function XGLTT  34.48 
 
 		 324 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.04272  normal  0.133986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>