25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0655 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0655  Pericardin like protein  100 
 
 		 684 aa  1309    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.541208  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0607  hypothetical protein  32.59 
 
 		 548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0554  hypothetical protein  33.95 
 
 		 394 aa  87.4  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  48.15 
 
 		 527 aa  71.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2411  hypothetical protein  40.88 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0411768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  38.08 
 
 		 971 aa  61.6  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1198 aa  57  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0854  hypothetical protein  36.11 
 
 		 500 aa  56.6  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.939833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0910  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.86 
 
 		 704 aa  55.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  44.44 
 
 		 688 aa  53.9  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  46.23 
 
 		 750 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  44 
 
 		 1126 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.23 
 
 		 2449 aa  51.2  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  39.58 
 
 		 1128 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0823  hypothetical protein  53.66 
 
 		 492 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.94 
 
 		 252 aa  48.9  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  30.43 
 
 		 746 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6372  glycosyl transferase family protein  51.16 
 
 		 600 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1158  repeat of unknown function XGLTT  31.03 
 
 		 324 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.04272  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4835  hypothetical protein  39.73 
 
 		 1168 aa  47.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.391306  decreased coverage  0.000518688 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15555  predicted protein  31.61 
 
 		 1706 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7194  hypothetical protein  39.68 
 
 		 462 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.663693 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26100  predicted protein  33.05 
 
 		 1646 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.490738  normal  0.061037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3871  Vitamin K-dependent gamma-carboxylase  42.55 
 
 		 522 aa  43.9  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.209528  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  40.21 
 
 		 1161 aa  43.9  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>