11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF04670 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF04670  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 2094 aa  4139    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02086  Nuclear pore complex protein An-Nup159 (Eurofung)  30.53 
 
 		 1394 aa  150  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.919136  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04570  conserved hypothetical protein  36.4 
 
 		 567 aa  75.5  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.375715  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80670  nuclear pore protein  28.18 
 
 		 1203 aa  73.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23918  predicted protein  38.89 
 
 		 1000 aa  70.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160353  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  35.53 
 
 		 1689 aa  61.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04595  An-Nup2 Nuclear pore complex protein (Eurofung)  38.6 
 
 		 512 aa  55.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  40.7 
 
 		 819 aa  50.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  24.38 
 
 		 623 aa  49.7  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2130  hypothetical protein  22.49 
 
 		 242 aa  48.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  17.02 
 
 		 657 aa  46.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>