18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_23918 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_23918  predicted protein  100 
 
 
1000 aa  1831    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160353  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42583  nuclear pore protein  30.29 
 
 
951 aa  170  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  40.28 
 
 
1689 aa  106  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29138  predicted protein  47.84 
 
 
766 aa  100  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0822603  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01140  nucleoporin nup189, putative  34.88 
 
 
1927 aa  80.1  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.444999  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82631  predicted protein  38.32 
 
 
551 aa  76.6  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.293318 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80553  Nucleoporin NUP145 precursor (Nuclear pore protein NUP145) Contains: Nucleoporin NUP145N (N-NUP145) Nucleoporin NUP145C (C-NUP145)  37.96 
 
 
1348 aa  75.5  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04670  conserved hypothetical protein  39.94 
 
 
2094 aa  71.2  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66703  Nucleoporin NUP49/NSP49 (Nuclear pore protein NUP49/NSP49)  43.82 
 
 
402 aa  66.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04010  hypothetical protein  38.52 
 
 
477 aa  57  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66612  predicted protein  39.45 
 
 
449 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88123  Nucleoporin NSP1 (Nuclear pore protein NSP1) (Nucleoskeletal-like protein) (p110)  31.8 
 
 
727 aa  49.7  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.26666  normal  0.354188 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05627  Putative uncharacterized proteinSONB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873R2]  26.71 
 
 
1962 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0410188 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28983  predicted protein  37.25 
 
 
1556 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04570  conserved hypothetical protein  36.26 
 
 
567 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.375715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6457  hypothetical protein  32.62 
 
 
1645 aa  45.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0255771  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80670  nuclear pore protein  30.03 
 
 
1203 aa  45.4  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381762  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01698  transcription initiation protein spt5 (AFU_orthologue; AFUA_4G08500)  39.44 
 
 
920 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80397  normal  0.06585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>