28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2130 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2130  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  478  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001699  predicted zinc-binding protein  40.34 
 
 		 221 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0428  hypothetical protein  37.67 
 
 		 213 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00774  hypothetical protein  51.89 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0683  hypothetical protein  27.93 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0561  hypothetical protein  26.44 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.618425  normal  0.714109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0543  hypothetical protein  28.37 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.902845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3495  hypothetical protein  26.07 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5025  hypothetical protein  29.91 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3396  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.08 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0333866  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1565  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  38.37 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0553  hypothetical protein  24.76 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1039  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1817  hypothetical protein  23.41 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0706  hypothetical protein  25.23 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  54.9 
 
 		 759 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  54.9 
 
 		 759 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0296  hypothetical protein  27.18 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11320  hypothetical protein  30.62 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3863  hypothetical protein  28.78 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.959734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0508  hypothetical protein  44.12 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4469  hypothetical protein  34.44 
 
 		 195 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.580339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1827  hypothetical protein  30.63 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1976  hypothetical protein  25.81 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  55.56 
 
 		 955 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06650  hypothetical protein  22.33 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3559  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  43.06 
 
 		 188 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2159  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>