26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3495 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3495  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5025  hypothetical protein  37.8 
 
 
197 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0683  hypothetical protein  36.6 
 
 
195 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0543  hypothetical protein  37.04 
 
 
193 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0553  hypothetical protein  37.04 
 
 
191 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1039  hypothetical protein  37.79 
 
 
190 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0561  hypothetical protein  35.4 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.618425  normal  0.714109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4469  hypothetical protein  32.92 
 
 
195 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.580339  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11320  hypothetical protein  38.55 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370966  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3863  hypothetical protein  37.89 
 
 
192 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.959734  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1827  hypothetical protein  32.8 
 
 
180 aa  92  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0508  hypothetical protein  35.4 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1817  hypothetical protein  30.48 
 
 
206 aa  88.6  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0706  hypothetical protein  31.08 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0428  hypothetical protein  28.14 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06650  hypothetical protein  35.71 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15752  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3396  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.68 
 
 
198 aa  77  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0333866  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1565  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.52 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3429  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.02 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3559  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.21 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001699  predicted zinc-binding protein  24.65 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2130  hypothetical protein  26.07 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1976  hypothetical protein  25.53 
 
 
190 aa  72  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00774  hypothetical protein  40.62 
 
 
232 aa  72  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2159  hypothetical protein  30.32 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0296  hypothetical protein  23.12 
 
 
225 aa  52  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>