25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1039 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1039  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11320  hypothetical protein  92.35 
 
 
196 aa  274  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370966  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5025  hypothetical protein  65.36 
 
 
197 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0543  hypothetical protein  63.8 
 
 
193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0561  hypothetical protein  64.6 
 
 
194 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.618425  normal  0.714109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0683  hypothetical protein  54.75 
 
 
195 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0553  hypothetical protein  60.98 
 
 
191 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4469  hypothetical protein  54.19 
 
 
195 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.580339  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0508  hypothetical protein  62.35 
 
 
193 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3863  hypothetical protein  62.35 
 
 
192 aa  160  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.959734  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06650  hypothetical protein  51.23 
 
 
189 aa  151  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3495  hypothetical protein  37.5 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0706  hypothetical protein  37.11 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2130  hypothetical protein  30.99 
 
 
242 aa  84.7  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1827  hypothetical protein  33.53 
 
 
180 aa  82  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0428  hypothetical protein  30.27 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1817  hypothetical protein  28.92 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1565  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.64 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001699  predicted zinc-binding protein  26.26 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3559  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.26 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1976  hypothetical protein  28.65 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3396  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.93 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0333866  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3429  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.34 
 
 
195 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2159  hypothetical protein  29.86 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00774  hypothetical protein  39.71 
 
 
232 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>