25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1565 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1565  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  100 
 
 		 193 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3396  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  49.72 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0333866  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1827  hypothetical protein  44.44 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3559  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  44.79 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222842 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0706  hypothetical protein  34.93 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1976  hypothetical protein  27.81 
 
 		 190 aa  85.1  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3495  hypothetical protein  29.66 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1039  hypothetical protein  31.94 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5025  hypothetical protein  36.67 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2130  hypothetical protein  35.29 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00774  hypothetical protein  39.22 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0683  hypothetical protein  33.1 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11320  hypothetical protein  34 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0561  hypothetical protein  33.1 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.618425  normal  0.714109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0543  hypothetical protein  32.41 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.902845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0553  hypothetical protein  32.17 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4469  hypothetical protein  31.72 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.580339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001699  predicted zinc-binding protein  35.16 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06650  hypothetical protein  28.87 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15752  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3863  hypothetical protein  34.03 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.959734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0508  hypothetical protein  31.03 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2159  hypothetical protein  32.21 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0428  hypothetical protein  22.15 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3429  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.83 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1817  hypothetical protein  25.83 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>