26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4469 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4469  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.580339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0683  hypothetical protein  95.9 
 
 		 195 aa  346  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5025  hypothetical protein  65.83 
 
 		 197 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1039  hypothetical protein  54.6 
 
 		 190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0553  hypothetical protein  53.05 
 
 		 191 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0543  hypothetical protein  53.29 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.902845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0561  hypothetical protein  52.44 
 
 		 194 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.618425  normal  0.714109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0508  hypothetical protein  50.92 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11320  hypothetical protein  52.66 
 
 		 196 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3863  hypothetical protein  54.94 
 
 		 192 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.959734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06650  hypothetical protein  43.21 
 
 		 189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3495  hypothetical protein  33.95 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1827  hypothetical protein  33.77 
 
 		 180 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0706  hypothetical protein  31.54 
 
 		 183 aa  84.7  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2130  hypothetical protein  27.93 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1817  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1565  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.1 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0428  hypothetical protein  28.65 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3396  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.59 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0333866  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3559  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.67 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001699  predicted zinc-binding protein  24.66 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1976  hypothetical protein  24.59 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0296  hypothetical protein  23.3 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3429  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.06 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2159  hypothetical protein  27.08 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00774  hypothetical protein  31.63 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>