27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00774 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00774  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001699  predicted zinc-binding protein  54.31 
 
 
221 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2130  hypothetical protein  48.99 
 
 
242 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3495  hypothetical protein  26.83 
 
 
190 aa  82  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1817  hypothetical protein  28.79 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0296  hypothetical protein  28.76 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1039  hypothetical protein  27.09 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1565  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  37.62 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3396  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  35.09 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0333866  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0706  hypothetical protein  22.71 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0683  hypothetical protein  27.72 
 
 
195 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5025  hypothetical protein  27.23 
 
 
197 aa  62  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11320  hypothetical protein  26.11 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370966  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0428  hypothetical protein  36.51 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1976  hypothetical protein  31.37 
 
 
190 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  55.56 
 
 
759 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  55.56 
 
 
759 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1827  hypothetical protein  29.13 
 
 
180 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3559  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  35.79 
 
 
188 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0561  hypothetical protein  23.04 
 
 
194 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.618425  normal  0.714109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2159  hypothetical protein  38.98 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06650  hypothetical protein  25.62 
 
 
189 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0543  hypothetical protein  24.02 
 
 
193 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0553  hypothetical protein  22.55 
 
 
191 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11341  ABC transporter substrate-binding protein  28.87 
 
 
513 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4469  hypothetical protein  23.77 
 
 
195 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.580339  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3429  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.72 
 
 
195 aa  41.6  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>