25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11320 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_11320  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370966  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1039  hypothetical protein  92.86 
 
 
190 aa  293  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5025  hypothetical protein  65.38 
 
 
197 aa  208  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0543  hypothetical protein  63.31 
 
 
193 aa  197  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.902845  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0561  hypothetical protein  63.47 
 
 
194 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.618425  normal  0.714109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0683  hypothetical protein  54.59 
 
 
195 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0553  hypothetical protein  60 
 
 
191 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4469  hypothetical protein  54.05 
 
 
195 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.580339  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0508  hypothetical protein  59.52 
 
 
193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3863  hypothetical protein  59.52 
 
 
192 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.959734  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06650  hypothetical protein  49.4 
 
 
189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3495  hypothetical protein  37.24 
 
 
190 aa  111  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0706  hypothetical protein  37.27 
 
 
183 aa  94.7  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2130  hypothetical protein  30.42 
 
 
242 aa  84.3  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0428  hypothetical protein  30.61 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1817  hypothetical protein  30.39 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1565  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1827  hypothetical protein  31.4 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001699  predicted zinc-binding protein  26.7 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3396  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.4 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0333866  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3559  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.22 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1976  hypothetical protein  29.35 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3429  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.74 
 
 
195 aa  58.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2159  hypothetical protein  28.67 
 
 
177 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00774  hypothetical protein  36.46 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>