25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0508 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0508  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0543  hypothetical protein  93.33 
 
 		 193 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.902845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0553  hypothetical protein  88.96 
 
 		 191 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0561  hypothetical protein  81.82 
 
 		 194 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.618425  normal  0.714109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5025  hypothetical protein  66.3 
 
 		 197 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1039  hypothetical protein  62.35 
 
 		 190 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0683  hypothetical protein  54.14 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4469  hypothetical protein  51.69 
 
 		 195 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.580339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3863  hypothetical protein  62.35 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.959734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06650  hypothetical protein  51.23 
 
 		 189 aa  157  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11320  hypothetical protein  57.47 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1827  hypothetical protein  37.5 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3495  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  104  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0706  hypothetical protein  36.02 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2130  hypothetical protein  27.93 
 
 		 242 aa  85.9  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3559  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.55 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222842 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3396  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.68 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0333866  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0428  hypothetical protein  31.52 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1565  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.86 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1817  hypothetical protein  26.52 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1976  hypothetical protein  26.35 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3429  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.33 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001699  predicted zinc-binding protein  22.87 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2159  hypothetical protein  27.08 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00774  hypothetical protein  31.25 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>