25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0553 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0553  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0543  hypothetical protein  90.06 
 
 		 193 aa  297  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.902845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0508  hypothetical protein  84.66 
 
 		 193 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0561  hypothetical protein  82.21 
 
 		 194 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.618425  normal  0.714109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5025  hypothetical protein  66.5 
 
 		 197 aa  204  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0683  hypothetical protein  56.28 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1039  hypothetical protein  60.37 
 
 		 190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4469  hypothetical protein  56.12 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.580339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3863  hypothetical protein  58.39 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.959734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11320  hypothetical protein  58.14 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06650  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1827  hypothetical protein  38.67 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3495  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0706  hypothetical protein  35.85 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3559  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222842 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2130  hypothetical protein  25.68 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0428  hypothetical protein  30.51 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3396  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.99 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0333866  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1565  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.17 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1817  hypothetical protein  27.93 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3429  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.92 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1976  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001699  predicted zinc-binding protein  22.12 
 
 		 221 aa  52.4  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2159  hypothetical protein  26.06 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00774  hypothetical protein  39.06 
 
 		 232 aa  41.2  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>