26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0683 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0683  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4469  hypothetical protein  95.9 
 
 		 195 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.580339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5025  hypothetical protein  65.83 
 
 		 197 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1039  hypothetical protein  55.21 
 
 		 190 aa  171  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0543  hypothetical protein  53.89 
 
 		 193 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.902845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0553  hypothetical protein  52.69 
 
 		 191 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0561  hypothetical protein  52.44 
 
 		 194 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.618425  normal  0.714109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11320  hypothetical protein  53.25 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0370966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3863  hypothetical protein  54.94 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.959734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0508  hypothetical protein  50.92 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06650  hypothetical protein  42.59 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.15752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3495  hypothetical protein  34.55 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1827  hypothetical protein  33.77 
 
 		 180 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0706  hypothetical protein  31.54 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2130  hypothetical protein  27.93 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3396  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.31 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0333866  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1817  hypothetical protein  25.12 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0428  hypothetical protein  29.21 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1565  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.1 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3559  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.67 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222842 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001699  predicted zinc-binding protein  24.45 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0296  hypothetical protein  23.3 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3429  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.06 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1976  hypothetical protein  24.73 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2159  hypothetical protein  26.14 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00774  hypothetical protein  32.14 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>