12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0296 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0296  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2130  hypothetical protein  27.18 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00774  hypothetical protein  34.94 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001699  predicted zinc-binding protein  38.46 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1817  hypothetical protein  24.88 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0683  hypothetical protein  23.19 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3396  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.04 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0333866  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3495  hypothetical protein  23.12 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1976  hypothetical protein  21.15 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0706  hypothetical protein  21.43 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0428  hypothetical protein  32.91 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  28.98 
 
 		 407 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>