31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1221 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1277    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16100  hypothetical protein  28.97 
 
 
536 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2493  hypothetical protein  33.61 
 
 
512 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  37.59 
 
 
370 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  22.33 
 
 
444 aa  67  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  30.56 
 
 
427 aa  63.9  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  30.89 
 
 
418 aa  58.5  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  31.67 
 
 
432 aa  58.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  37.78 
 
 
435 aa  58.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  37.72 
 
 
397 aa  57.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  32.52 
 
 
489 aa  55.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  31.15 
 
 
405 aa  54.7  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  31.15 
 
 
405 aa  54.7  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  27.22 
 
 
380 aa  53.9  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  22.82 
 
 
402 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  27.81 
 
 
370 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  25.17 
 
 
477 aa  52.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  32.18 
 
 
528 aa  52  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0392  spore germination protein IA  32.93 
 
 
754 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  26.61 
 
 
389 aa  50.4  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  28.23 
 
 
387 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2286  hypothetical protein  32.19 
 
 
456 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  30.91 
 
 
445 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  30.91 
 
 
445 aa  48.9  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  28.57 
 
 
420 aa  48.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  27.72 
 
 
481 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  27.2 
 
 
754 aa  47.4  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1356  RNA-binding S4 domain protein  26.14 
 
 
736 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  21.85 
 
 
533 aa  45.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  33.04 
 
 
388 aa  44.3  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1533  hypothetical protein  23.15 
 
 
146 aa  43.9  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.2294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>