59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1545 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  803    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  32.75 
 
 
420 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  29.67 
 
 
388 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  30.65 
 
 
427 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  31.93 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  31.66 
 
 
528 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  32.03 
 
 
418 aa  144  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  32.14 
 
 
387 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  27.32 
 
 
370 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  32.53 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  32.53 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  32.64 
 
 
401 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  30 
 
 
426 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  30.58 
 
 
402 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  30.83 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  30.21 
 
 
396 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  29.92 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  33.33 
 
 
444 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  28.91 
 
 
386 aa  86.3  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  30.93 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  27.91 
 
 
608 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  27.68 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  29.5 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  28.65 
 
 
432 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1929  hypothetical protein  27.32 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  38.94 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  26.41 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2567  hypothetical protein  37.07 
 
 
234 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00357801  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  25.93 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  28.29 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  33.33 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  23.3 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  24.7 
 
 
459 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  26.07 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16100  hypothetical protein  32.55 
 
 
536 aa  67  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  24.51 
 
 
458 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  26.27 
 
 
405 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1785  hypothetical protein  25.74 
 
 
436 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.989427  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  28.26 
 
 
489 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  25.8 
 
 
436 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  26.87 
 
 
416 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  21.09 
 
 
445 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  21.37 
 
 
445 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  28.71 
 
 
459 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  26.02 
 
 
397 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  23.78 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  26.02 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  28.17 
 
 
488 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  37.72 
 
 
623 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1974  hypothetical protein  26.19 
 
 
424 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0525296  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  24.31 
 
 
456 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  32.43 
 
 
426 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  32.43 
 
 
426 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2493  hypothetical protein  35.4 
 
 
512 aa  53.5  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  30.1 
 
 
412 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  27.04 
 
 
385 aa  50.1  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  26.35 
 
 
415 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  26.85 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  26.57 
 
 
402 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>