27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16100 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16100  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1099    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  28.97 
 
 
623 aa  289  7e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2493  hypothetical protein  34.66 
 
 
512 aa  289  9e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  26.07 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  23.17 
 
 
427 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  25.16 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  28.72 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  34.08 
 
 
397 aa  65.1  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  34.71 
 
 
370 aa  64.3  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  27.36 
 
 
405 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  27.36 
 
 
405 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  35.57 
 
 
528 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  33.83 
 
 
387 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  26.51 
 
 
420 aa  57.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  24.35 
 
 
481 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  30.88 
 
 
380 aa  57  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  36.22 
 
 
432 aa  56.6  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  33.07 
 
 
389 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  29.6 
 
 
489 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  28.51 
 
 
370 aa  50.8  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  29.03 
 
 
477 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  28.86 
 
 
488 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  29.23 
 
 
445 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  29.37 
 
 
445 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  26.26 
 
 
402 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  26.12 
 
 
401 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  27.91 
 
 
409 aa  43.5  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>