62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0871 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  733    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  43.55 
 
 		 435 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  28.91 
 
 		 388 aa  143  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  31.43 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  32.09 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  32.09 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  30.16 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  29.93 
 
 		 418 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  31.09 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  27.9 
 
 		 427 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  30.2 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  30.43 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  29.57 
 
 		 528 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  29.92 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  23.16 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  30.71 
 
 		 432 aa  116  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  27.88 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  35.77 
 
 		 444 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  34.76 
 
 		 481 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  24.46 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  29.11 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  27.35 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  27.69 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  35.43 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  29.36 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  27.34 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  27.09 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  28.88 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  23.08 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  22.78 
 
 		 445 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  27.32 
 
 		 477 aa  66.2  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  28.11 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  27.16 
 
 		 459 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  26.11 
 
 		 458 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  26.49 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  25 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  24.19 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  26.05 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  35.2 
 
 		 427 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  25.39 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  26.36 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  36.92 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  27.2 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  27.2 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1785  hypothetical protein  36.36 
 
 		 436 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.989427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  27.81 
 
 		 623 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  27.3 
 
 		 608 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16100  hypothetical protein  28.51 
 
 		 536 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  34.85 
 
 		 436 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  48.48 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  20.63 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1912  hypothetical protein  29.38 
 
 		 458 aa  50.1  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2493  hypothetical protein  22.06 
 
 		 512 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  31.78 
 
 		 386 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  26.74 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1929  hypothetical protein  29.73 
 
 		 609 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  21.54 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  26.86 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  25.22 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  23.62 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  31.76 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  22.4 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>