36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1799 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  885    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  28.71 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  24.07 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  24.02 
 
 		 445 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  23.77 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  25.4 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  23.08 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  25.71 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  24.8 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  22.29 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  23.51 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  30.81 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  23.32 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  30.81 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  28.21 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  21.91 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  23.04 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  24.01 
 
 		 390 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  23.54 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  23.24 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  22.19 
 
 		 427 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  23 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  23.73 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  23.73 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  21.21 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  26.15 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  21.79 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  23.47 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  26.15 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  25.61 
 
 		 488 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  23.62 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  29.41 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  22.43 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  29.88 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  21.11 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>