51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1260 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  843    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  27.25 
 
 
402 aa  100  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  27.23 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  27.27 
 
 
389 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  24.41 
 
 
388 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  24.8 
 
 
387 aa  86.3  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  26.68 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  25.25 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  25.18 
 
 
528 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  24.22 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  24.75 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  25.43 
 
 
608 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  27.72 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  27.15 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  28.52 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  30.13 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  23.76 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  30.77 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  22.95 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  22.95 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  25.23 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  26.05 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  23.34 
 
 
370 aa  64.3  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  22.52 
 
 
481 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  27.75 
 
 
444 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  32.95 
 
 
797 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  24.4 
 
 
370 aa  60.1  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  22.86 
 
 
394 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  25.45 
 
 
488 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  20.63 
 
 
389 aa  57.4  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1974  hypothetical protein  23.1 
 
 
424 aa  56.6  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0525296  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  27.15 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  22.61 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  33.73 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1912  hypothetical protein  30.3 
 
 
458 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  32.95 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  21.78 
 
 
456 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  32.89 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  21.82 
 
 
459 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  22.28 
 
 
489 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  22.67 
 
 
459 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1929  hypothetical protein  27.8 
 
 
609 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  25 
 
 
446 aa  47.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  30.34 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  36.36 
 
 
435 aa  46.6  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  25 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  31.48 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  31.48 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  24.54 
 
 
458 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  26.78 
 
 
390 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  26.53 
 
 
409 aa  43.1  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>