57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0354 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  806    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  71.58 
 
 		 390 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  63.99 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  63.73 
 
 		 386 aa  471  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  60.41 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  29.77 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  30.35 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  25.59 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  25.59 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  29.06 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  27.21 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  28.39 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  24.94 
 
 		 388 aa  97.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  26.76 
 
 		 420 aa  97.1  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  27.62 
 
 		 405 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  27.62 
 
 		 405 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  27.03 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  24.45 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  25.69 
 
 		 481 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  24.18 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  23.95 
 
 		 394 aa  92.8  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  23.73 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  26.99 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  30.13 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  24.07 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  27.87 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  27.35 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  25.2 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  25.32 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  28.17 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  23.08 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  21.22 
 
 		 489 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  25 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2671  hypothetical protein  27.23 
 
 		 448 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000573065  normal  0.0522315 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  33.67 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  27.05 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  27.61 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  32.12 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  27.49 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  31.87 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  23.21 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  27.22 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  28.17 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  29.33 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  35.04 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  26.56 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  25 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  25 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4120  VWA containing CoxE family protein  27.6 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  27.13 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1912  hypothetical protein  28.05 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  30.26 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2493  hypothetical protein  21.65 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  37.5 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1785  hypothetical protein  23.37 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.989427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  26.78 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  23.37 
 
 		 436 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>