57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0248 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  861    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  54.03 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  54.59 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  53.59 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  51.75 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  35.41 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1785  hypothetical protein  35.86 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.989427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  35.41 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1974  hypothetical protein  36.43 
 
 		 424 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0525296  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  34.92 
 
 		 405 aa  167  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  30.85 
 
 		 528 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  26.68 
 
 		 481 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  27.23 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  26.59 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  28.15 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  23.74 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  27.37 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  28.96 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  28.96 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  28.18 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  28.57 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  25.5 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  28.36 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  26.37 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  33.67 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  26.96 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  30.73 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  26.77 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  22.57 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  27.11 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  29.76 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  40.3 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  27.18 
 
 		 401 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  26.8 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  29.04 
 
 		 386 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  31.82 
 
 		 797 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  21.32 
 
 		 445 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  21.03 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  28.25 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  27.55 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  27.88 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  26.79 
 
 		 426 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  26.79 
 
 		 426 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  33.93 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  33.79 
 
 		 488 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  23.49 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  28.72 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  23.68 
 
 		 623 aa  47  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  33.33 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1912  hypothetical protein  22.46 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  25.77 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  36.7 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  29.53 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2493  hypothetical protein  29.94 
 
 		 512 aa  43.9  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4120  VWA containing CoxE family protein  27.64 
 
 		 460 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  25.35 
 
 		 459 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>