29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3121 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  949    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  25.43 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  22.25 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  25.84 
 
 		 528 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  28.24 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  25.39 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  17.7 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  24.59 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  24.59 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  23.84 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  24.44 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  25.48 
 
 		 481 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  25.29 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  31.82 
 
 		 397 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  34.02 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  21.9 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  26.54 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  21.72 
 
 		 445 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  21.31 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  24.47 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  23.9 
 
 		 427 aa  47.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  22.32 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  22.08 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  31.94 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  22.85 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  22.22 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  26.15 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  25 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  27.8 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>