51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1402 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  927    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  82.57 
 
 		 458 aa  759    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  80.83 
 
 		 459 aa  762    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  66.96 
 
 		 456 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  53.81 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  34.19 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1785  hypothetical protein  33.62 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.989427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  33.4 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1974  hypothetical protein  34.19 
 
 		 424 aa  176  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0525296  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  30.59 
 
 		 405 aa  164  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  26.16 
 
 		 418 aa  91.3  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  28.23 
 
 		 528 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  26.92 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  25.06 
 
 		 481 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  26.86 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  26.86 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  26.65 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  28.11 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  24.09 
 
 		 388 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  28.51 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  26.46 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  25 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  23.36 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  27.83 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  27.32 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  24.94 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  24.95 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  25.19 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  29.77 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  20.59 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  28.17 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  34.07 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  23.29 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  29.36 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  30.93 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  26.64 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  24.01 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  24.01 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0623  hypothetical protein  29.28 
 
 		 791 aa  53.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103441 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  28.07 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  23.56 
 
 		 416 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  27.49 
 
 		 397 aa  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  24.88 
 
 		 389 aa  50.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  22.59 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1912  hypothetical protein  25.47 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  31.11 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  27.7 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  29.01 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  28.67 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  32.2 
 
 		 797 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  32.08 
 
 		 477 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>