42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0638 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  98.88 
 
 		 445 aa  895    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  905    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  38.67 
 
 		 489 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  27.25 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  24.02 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  25.59 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  24.19 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  27.22 
 
 		 397 aa  90.5  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  27.22 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  22.92 
 
 		 418 aa  87.4  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  23.98 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  25.25 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  24.56 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  23.64 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  22.47 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  20.77 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  21.65 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  23.08 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  19.75 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  23.86 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  27.27 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  23.81 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  23.81 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  29.31 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  27.59 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  21.88 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  29.01 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  23.32 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  21 
 
 		 397 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  21.7 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  25.87 
 
 		 402 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  23.91 
 
 		 481 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  22.51 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  24.19 
 
 		 528 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  21.72 
 
 		 459 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  21.66 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  30.91 
 
 		 623 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  21.03 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  22.74 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2493  hypothetical protein  29.09 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  20.22 
 
 		 402 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16100  hypothetical protein  29.23 
 
 		 536 aa  45.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>