44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3320 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  793    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  74.69 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  47.76 
 
 		 488 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  36.04 
 
 		 427 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  37.35 
 
 		 477 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  35.93 
 
 		 426 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  35.93 
 
 		 426 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  36.38 
 
 		 412 aa  169  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  35.03 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  35.64 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  44.71 
 
 		 797 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1912  hypothetical protein  35.83 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2671  hypothetical protein  31.53 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000573065  normal  0.0522315 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  36.36 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4120  VWA containing CoxE family protein  29.96 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  34.97 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  36.21 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  27.88 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  25.6 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  25.81 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  26.32 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  27.49 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  31.23 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  26.05 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  33.22 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  24.76 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  24.48 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  24.48 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  32.12 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  25 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  28.03 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  30.65 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  28.87 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  27.22 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  22.74 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  22.74 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  34.91 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  29.01 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  29.14 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  29.23 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  34.44 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  26.9 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  31.71 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  24.15 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>