38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5997 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  823    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  28.11 
 
 
397 aa  94.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  31.79 
 
 
608 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  25.36 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1929  hypothetical protein  29.57 
 
 
609 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  26.92 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  25.17 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  26.58 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  25.14 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  24.14 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  33.87 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  24.17 
 
 
481 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  25.26 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  27.66 
 
 
394 aa  56.2  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4120  VWA containing CoxE family protein  23.39 
 
 
460 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  25.34 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  26.96 
 
 
370 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  27.81 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  33.33 
 
 
416 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  34.07 
 
 
427 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  26.57 
 
 
402 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  25.06 
 
 
415 aa  53.5  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  27 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  28.03 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  27.66 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  25 
 
 
405 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  25 
 
 
405 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  22.22 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  25.3 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1785  hypothetical protein  24.64 
 
 
436 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.989427  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  24.35 
 
 
435 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  28.37 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  25.79 
 
 
420 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  30.53 
 
 
797 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16100  hypothetical protein  27.91 
 
 
536 aa  43.9  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  28.24 
 
 
426 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  28.24 
 
 
426 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  25.65 
 
 
436 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>