52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0986 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  794    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  62.21 
 
 
390 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  65.37 
 
 
393 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  65.63 
 
 
386 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  60.41 
 
 
396 aa  484  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  29.01 
 
 
427 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  29.64 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  28.95 
 
 
389 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  29.59 
 
 
444 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  27.84 
 
 
418 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  24.89 
 
 
481 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  27.01 
 
 
528 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  28.82 
 
 
405 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  28.82 
 
 
405 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  25.48 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  29.5 
 
 
397 aa  96.3  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  26.5 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  24.74 
 
 
445 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  28.9 
 
 
416 aa  93.6  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  24.49 
 
 
445 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  29.16 
 
 
426 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  24.7 
 
 
420 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  23.75 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  25.46 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  22.37 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  23.48 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  22.8 
 
 
397 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  25.78 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  28.07 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  28.22 
 
 
427 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  25.07 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  26.54 
 
 
458 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  25.52 
 
 
459 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  23.35 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  21.55 
 
 
489 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  28.11 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  29.63 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  28.25 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  28.57 
 
 
416 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  23.45 
 
 
370 aa  59.7  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2671  hypothetical protein  25.77 
 
 
448 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000573065  normal  0.0522315 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  29.76 
 
 
446 aa  57.4  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  30.34 
 
 
432 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  26.64 
 
 
459 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  26.04 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  26.04 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  25.46 
 
 
435 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  33.33 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  28.06 
 
 
488 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  24.22 
 
 
436 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  25.62 
 
 
608 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  24.93 
 
 
405 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>