39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1426 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  801    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  27.25 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  25.82 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  27.08 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  28.7 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  31.76 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  24.86 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  31.76 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  24.48 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  25.87 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  27.04 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  25.87 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  27.04 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  33.09 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  25.68 
 
 		 489 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  26.85 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  25.38 
 
 		 390 aa  53.5  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  24 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  24 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  35.37 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  24.44 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  26.15 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  23.73 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  26.57 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  28.1 
 
 		 797 aa  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  25.73 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  26.58 
 
 		 528 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  25.91 
 
 		 415 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  29.14 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  22.31 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  30.23 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  26.67 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  31.62 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  26.65 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  24.23 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  26.85 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  39.44 
 
 		 435 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1974  hypothetical protein  20.86 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0525296  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  23.79 
 
 		 420 aa  42.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>