48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1491 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  803    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  42.4 
 
 
436 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1785  hypothetical protein  44.47 
 
 
436 aa  318  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.989427  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  44.47 
 
 
436 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1974  hypothetical protein  44.66 
 
 
424 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0525296  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  30.59 
 
 
459 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  30.43 
 
 
458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  34.16 
 
 
446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  30.37 
 
 
459 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  30.72 
 
 
456 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  26.2 
 
 
427 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  26.65 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  23.91 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  25.75 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  25.18 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  24.45 
 
 
481 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  26.21 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  26.87 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  37.32 
 
 
528 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  24.26 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  29.46 
 
 
444 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  33.33 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  28.03 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  26.83 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  27.76 
 
 
426 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  27.76 
 
 
426 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  21.81 
 
 
445 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  25.68 
 
 
415 aa  57  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  21.16 
 
 
489 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  25.89 
 
 
397 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  24.64 
 
 
432 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  21.64 
 
 
445 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  26.78 
 
 
396 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  30.66 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  25.29 
 
 
402 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  25.67 
 
 
387 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  25.68 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  25.13 
 
 
390 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  27.84 
 
 
380 aa  49.7  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  26.57 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  36.09 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  24.18 
 
 
405 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  24.18 
 
 
405 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  28.36 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  27.61 
 
 
386 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2671  hypothetical protein  28.36 
 
 
448 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000573065  normal  0.0522315 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  32.14 
 
 
412 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  26.16 
 
 
459 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>