57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1813 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  97.73 
 
 
397 aa  795    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  810    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  50.64 
 
 
389 aa  443  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  47.97 
 
 
390 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  43.29 
 
 
394 aa  359  5e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  24.45 
 
 
396 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  27.22 
 
 
445 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  25.75 
 
 
390 aa  90.1  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  27.79 
 
 
445 aa  89.7  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  26.6 
 
 
420 aa  86.7  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  23.92 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  23.89 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  36.99 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  33.94 
 
 
528 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  25 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  25 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  25 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  25.97 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  23.92 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  23.48 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  24.25 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  23.81 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  33.55 
 
 
481 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  24.55 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  33.93 
 
 
488 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  26.97 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  30.46 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  31.14 
 
 
797 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  22.71 
 
 
416 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  27.15 
 
 
412 aa  63.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  24.19 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  24.78 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  23.67 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  24.78 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  30 
 
 
427 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  31.76 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  24.48 
 
 
404 aa  59.7  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  30.72 
 
 
427 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  28.65 
 
 
459 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  23 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  25.79 
 
 
397 aa  57.4  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  30.13 
 
 
415 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  29.24 
 
 
458 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2671  hypothetical protein  24.19 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000573065  normal  0.0522315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  33.33 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  29.53 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  28.07 
 
 
459 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  31.82 
 
 
459 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  28.26 
 
 
436 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  23.55 
 
 
402 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  28.77 
 
 
489 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4120  VWA containing CoxE family protein  26.88 
 
 
460 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  24.04 
 
 
608 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  33.33 
 
 
446 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  28.89 
 
 
456 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  23.58 
 
 
477 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4249  hypothetical protein  30.3 
 
 
475 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.482803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>