46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1785 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  88.53 
 
 		 436 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  98.85 
 
 		 436 aa  861    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1785  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  870    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.989427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  44.47 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1974  hypothetical protein  43.15 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0525296  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  33.62 
 
 		 459 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  34.26 
 
 		 458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  34.12 
 
 		 459 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  33.55 
 
 		 456 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  35.86 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  25.69 
 
 		 481 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  27.7 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  26.1 
 
 		 388 aa  93.2  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  25.8 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  28.17 
 
 		 418 aa  86.7  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  25.85 
 
 		 528 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  26.79 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  28.18 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  25.06 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  26.77 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  26.06 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  26.77 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  28.35 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  26.03 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  25.11 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  25.96 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  26.16 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  28.73 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  23.17 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  27.43 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  26.63 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  27.34 
 
 		 432 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  24.79 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4120  VWA containing CoxE family protein  32.2 
 
 		 460 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  26.09 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  29.77 
 
 		 370 aa  50.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2671  hypothetical protein  34.65 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000573065  normal  0.0522315 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  26.81 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  23.91 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  30.71 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  28 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  29.47 
 
 		 445 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  29.47 
 
 		 445 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  28.8 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  26.52 
 
 		 386 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  33.59 
 
 		 797 aa  43.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>