66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2963 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  853    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  51.08 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  48.67 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  33.04 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  32.14 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  33 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  33 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  32.37 
 
 		 401 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  32.32 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  29.59 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  29.28 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  32.75 
 
 		 397 aa  156  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  29.72 
 
 		 387 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  25.43 
 
 		 370 aa  143  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  30.51 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  29.3 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  30.2 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  32.52 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  26.76 
 
 		 396 aa  97.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  27.76 
 
 		 432 aa  96.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  39.87 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  25.58 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  28.67 
 
 		 436 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  34.71 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  25.59 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  25.29 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  34.97 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1912  hypothetical protein  28.02 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  26.55 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  26.75 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  22.59 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  30.03 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  23.87 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  22.16 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  27.39 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  26.27 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  26.49 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  25.41 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  25.75 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1785  hypothetical protein  27.9 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.989427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  23.81 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  23.81 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  25.53 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  20.77 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  20.53 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  27.68 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  26.49 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  21.88 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  28.52 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  21.07 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  25.18 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  25.92 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1929  hypothetical protein  34.43 
 
 		 609 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  34.43 
 
 		 608 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  24.25 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  24.25 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  23.04 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16100  hypothetical protein  26.51 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  25.13 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  28.1 
 
 		 797 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1974  hypothetical protein  24.02 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0525296  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  26.58 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2493  hypothetical protein  26.17 
 
 		 512 aa  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  24.47 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  28.57 
 
 		 623 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  23.59 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>