32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1121 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  100 
 
 
608 aa  1221    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1929  hypothetical protein  54.39 
 
 
609 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  31.79 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  26.7 
 
 
397 aa  79.7  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  24.16 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  24.75 
 
 
426 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  35.16 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  48.78 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  35 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  35 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  35.17 
 
 
528 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  34.85 
 
 
401 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  34.09 
 
 
427 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  37.5 
 
 
402 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  26.61 
 
 
389 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  24.3 
 
 
390 aa  62.4  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  28.97 
 
 
415 aa  62  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  23.69 
 
 
418 aa  60.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  24.72 
 
 
387 aa  60.5  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  34.43 
 
 
420 aa  60.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  30.65 
 
 
444 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  21.94 
 
 
394 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  33.85 
 
 
416 aa  55.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  28.53 
 
 
426 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  28.53 
 
 
426 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  27.3 
 
 
370 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  24.58 
 
 
388 aa  52  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  24.68 
 
 
415 aa  51.6  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  31.09 
 
 
416 aa  51.6  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  21.66 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  24.04 
 
 
397 aa  47.4  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  26.47 
 
 
385 aa  47  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>