38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0383 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  791    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  58.99 
 
 		 390 aa  471  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  51.03 
 
 		 397 aa  444  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  50.64 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  45.13 
 
 		 394 aa  345  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  24.54 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  23.73 
 
 		 396 aa  92.8  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  24.52 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  22.66 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  28.93 
 
 		 420 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  23.24 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  23.56 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  24.32 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  21.88 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  22.39 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  24.13 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  23.86 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  22.45 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  17.7 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  23.04 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  32.5 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  22.92 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  30.07 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  23.24 
 
 		 430 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  26.27 
 
 		 458 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  25.81 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  26.85 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  24.17 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  21.34 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  21.34 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  23.76 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  24.88 
 
 		 459 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  21.66 
 
 		 608 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  33.91 
 
 		 456 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  28.37 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  24.53 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  22.4 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  23.18 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>