52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1217 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  80.83 
 
 		 459 aa  743    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  91.94 
 
 		 458 aa  837    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  931    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  69.26 
 
 		 456 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  53.38 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  33.76 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1785  hypothetical protein  33.19 
 
 		 436 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.989427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  32.98 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  30.59 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1974  hypothetical protein  32.62 
 
 		 424 aa  160  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0525296  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  28.45 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  26.89 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  25.5 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  25.5 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  27.44 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  24.89 
 
 		 481 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  27 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  24.45 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  26.55 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  24.52 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  26.65 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  23.87 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  27.34 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  25.87 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  26.56 
 
 		 435 aa  67  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  26.27 
 
 		 401 aa  67  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  24.45 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  32.53 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  25.22 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  32.12 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  21.63 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  33.85 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  28.65 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  28.64 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  30 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  28.07 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  25.81 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  23.84 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  28.46 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  23.65 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  32.59 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  26.35 
 
 		 394 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0623  hypothetical protein  26.63 
 
 		 791 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103441 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  24.07 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  24.8 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  24.8 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1912  hypothetical protein  24.74 
 
 		 458 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  33.93 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  31.54 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  26.09 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  29.08 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  33.33 
 
 		 797 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>