57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2359 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  872    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  33.91 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  33.91 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  31.27 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  29.89 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  27.76 
 
 		 418 aa  119  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  27.46 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  27.52 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  28.64 
 
 		 426 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  37.02 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  26.02 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  25.34 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  26.36 
 
 		 387 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  28.24 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  28.2 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  27.82 
 
 		 427 aa  97.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  22.84 
 
 		 370 aa  86.3  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  25.53 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  27.7 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  26.07 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  29.82 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  21.88 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  21.88 
 
 		 445 aa  67  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  26.68 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1974  hypothetical protein  25.8 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0525296  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2493  hypothetical protein  33.85 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  27.46 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  31.67 
 
 		 623 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16100  hypothetical protein  28.4 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  33.56 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  24.29 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  25.91 
 
 		 396 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  24.82 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  25.13 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  30.34 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2671  hypothetical protein  23.99 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000573065  normal  0.0522315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  26.14 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1785  hypothetical protein  26.38 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.989427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  32.26 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  29 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  23.21 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4120  VWA containing CoxE family protein  25.12 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  24.88 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  28.57 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  31.82 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  31.82 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  31.11 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  26.24 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  34.91 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  32.31 
 
 		 458 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  32.32 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  23.99 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1912  hypothetical protein  29.85 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  23.99 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  19.89 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  23.7 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  27.8 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>