41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8669 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8669  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  976    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  46.3 
 
 		 416 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3320  hypothetical protein  47.91 
 
 		 404 aa  332  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  37.06 
 
 		 477 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  32.67 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  32.67 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  35.17 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  36.36 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  33.41 
 
 		 416 aa  143  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  43.06 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2671  hypothetical protein  32.97 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000573065  normal  0.0522315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1912  hypothetical protein  41.07 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  43.62 
 
 		 797 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4120  VWA containing CoxE family protein  28.75 
 
 		 460 aa  91.3  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  37.08 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  26.73 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  34.32 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  34.08 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  33.93 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  26.33 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  30.46 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  33.75 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  34.5 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  28.74 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  31.87 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  28.74 
 
 		 370 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  29.14 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  32.75 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  30.11 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  27.04 
 
 		 397 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  31.86 
 
 		 432 aa  53.9  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  27.96 
 
 		 390 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  26.83 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  28 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  28.48 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  28.71 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  30.33 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  21.46 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  33.79 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  28.95 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16100  hypothetical protein  28.86 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>