48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2041 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  100 
 
 
489 aa  1018    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  38.67 
 
 
445 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  39.53 
 
 
445 aa  319  6e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  24.07 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  24.88 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  26.33 
 
 
420 aa  96.3  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  26.6 
 
 
427 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  26.68 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  24.46 
 
 
370 aa  83.2  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  22.79 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  24.13 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  23.87 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  24.32 
 
 
435 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  21.22 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  22.04 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  22.88 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  23.24 
 
 
390 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  36.51 
 
 
387 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  24.48 
 
 
444 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  21.96 
 
 
459 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  27.63 
 
 
397 aa  60.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2493  hypothetical protein  33.64 
 
 
512 aa  57  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  22.76 
 
 
446 aa  56.6  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  22.6 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  21.35 
 
 
427 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  22.6 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  32.52 
 
 
623 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  25.68 
 
 
402 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  35.45 
 
 
389 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  23.22 
 
 
402 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  20.36 
 
 
459 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  21.16 
 
 
405 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16100  hypothetical protein  29.6 
 
 
536 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  21.79 
 
 
481 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  29 
 
 
432 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  23.75 
 
 
426 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  23.75 
 
 
426 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  26.34 
 
 
528 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  28.77 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  28.77 
 
 
397 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  21.05 
 
 
458 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  21.31 
 
 
459 aa  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  27.45 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  20.58 
 
 
426 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  21.35 
 
 
415 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  21.5 
 
 
456 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  21.29 
 
 
401 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4120  VWA containing CoxE family protein  24.14 
 
 
460 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>