36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0476 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  795    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  28.71 
 
 
430 aa  184  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  24.13 
 
 
489 aa  96.3  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  23.64 
 
 
445 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  23.71 
 
 
445 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  24.17 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  23.18 
 
 
427 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  25.77 
 
 
427 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  23.47 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  25.31 
 
 
394 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  28.22 
 
 
416 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  27.43 
 
 
436 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1491  hypothetical protein  24.16 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  25.87 
 
 
436 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  24.4 
 
 
420 aa  56.6  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  20.97 
 
 
380 aa  56.2  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1785  hypothetical protein  25.19 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.989427  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  22.64 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  23.87 
 
 
393 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  22.64 
 
 
397 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  23.66 
 
 
386 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  23.96 
 
 
390 aa  53.9  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  22.17 
 
 
420 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  23.23 
 
 
528 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  22.79 
 
 
435 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  27.88 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1974  hypothetical protein  27.98 
 
 
424 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0525296  normal  0.788975 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  25.28 
 
 
418 aa  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  27.46 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  21.83 
 
 
444 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  22.02 
 
 
608 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  20.75 
 
 
415 aa  46.2  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  19.51 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  26.67 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  21.88 
 
 
481 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  24.7 
 
 
426 aa  43.1  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>