63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5264 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  833    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  833    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  55.04 
 
 		 401 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  53.22 
 
 		 402 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  38.81 
 
 		 528 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  36.32 
 
 		 444 aa  256  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  33.86 
 
 		 481 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  35.52 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  36.71 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  36.07 
 
 		 427 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  33.92 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  33.08 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  31.71 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  33 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  26.98 
 
 		 370 aa  155  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  32.09 
 
 		 370 aa  139  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  31.19 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  32.34 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2359  hypothetical protein  33.91 
 
 		 432 aa  119  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.713793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0344  hypothetical protein  27.2 
 
 		 390 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00212968  hitchhiker  0.000000000000305035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0354  hypothetical protein  27.62 
 
 		 396 aa  96.3  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0986  hypothetical protein  28.83 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000103126  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  27.27 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  28.4 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1217  hypothetical protein  25.5 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2493  hypothetical protein  24.62 
 
 		 512 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1402  hypothetical protein  25.75 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1339  hypothetical protein  25.46 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.385739  normal  0.964416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1785  hypothetical protein  25.69 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.989427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2922  hypothetical protein  25.95 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1318  hypothetical protein  25.17 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1362  hypothetical protein  26.38 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0151  hypothetical protein  25.46 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  35 
 
 		 608 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  25.41 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2039  hypothetical protein  30.22 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.22874  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  26.39 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  26.39 
 
 		 426 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  28 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1851  uncharacterized protein-like protein  24.87 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0255  hypothetical protein  27.46 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566377  normal  0.227805 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16100  hypothetical protein  27.36 
 
 		 536 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000262808 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1813  hypothetical protein  24.78 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1929  hypothetical protein  35.83 
 
 		 609 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2826  hypothetical protein  24.51 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  27.71 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1912  hypothetical protein  25 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0638  hypothetical protein  23.81 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0159967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0624  hypothetical protein  23.53 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.150984  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  26.74 
 
 		 394 aa  57  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3121  hypothetical protein  24.59 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2041  hypothetical protein  22.6 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00906694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  31.15 
 
 		 623 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0383  hypothetical protein  21.34 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0248  hypothetical protein  32.26 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1799  hypothetical protein  23.73 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  25.82 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  24 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  22.48 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2567  hypothetical protein  31.62 
 
 		 234 aa  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00357801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  24.87 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1809  hypothetical protein  25.13 
 
 		 797 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000328089  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1974  hypothetical protein  23.2 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0525296  normal  0.788975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>