34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1929 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1929  hypothetical protein  100 
 
 		 609 aa  1214    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1121  hypothetical protein  54.39 
 
 		 608 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5997  hypothetical protein  30.33 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1545  hypothetical protein  27.09 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0659219  normal  0.827191 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2963  hypothetical protein  27.3 
 
 		 420 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5605  hypothetical protein  27.61 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1781  hypothetical protein  20.06 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1250  hypothetical protein  42.55 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.960427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0749  hypothetical protein  23.74 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.811974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1601  hypothetical protein  24.31 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2698  hypothetical protein  24.62 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1447  uncharacterized protein-like protein  22.02 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0521  hypothetical protein  24.8 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000103397  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1728  hypothetical protein  31.51 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00673366  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6510  hypothetical protein  25.82 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2285  hypothetical protein  35.25 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0300  hypothetical protein  23.78 
 
 		 390 aa  63.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00798  gp25  24.5 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.961728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0484  hypothetical protein  33.07 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5264  hypothetical protein  35.83 
 
 		 405 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.939307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1623  hypothetical protein  35.83 
 
 		 405 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0871  hypothetical protein  28.44 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.382779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3561  Protein of unknown function DUF2201, metallopeptidase-related protein  25.69 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2570  hypothetical protein  31.03 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3479  hypothetical protein  30.73 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5421  hypothetical protein  27.81 
 
 		 415 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.949478 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1260  hypothetical protein  26.63 
 
 		 415 aa  54.3  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1426  hypothetical protein  26.13 
 
 		 402 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0697136 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3481  hypothetical protein  28.08 
 
 		 412 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2867  hypothetical protein  30.77 
 
 		 416 aa  48.9  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.0606475 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5802  hypothetical protein  27.54 
 
 		 426 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000056359 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5626  hypothetical protein  27.54 
 
 		 426 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.289369 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0476  hypothetical protein  26.34 
 
 		 385 aa  47.8  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2937  hypothetical protein  26.13 
 
 		 477 aa  43.9  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>