11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2286 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2286  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  873    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2011  hypothetical protein  46.07 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2292  hypothetical protein  51.29 
 
 		 336 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2460  hypothetical protein  36.96 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.152252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3491  hypothetical protein  51.43 
 
 		 323 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3811  hypothetical protein  41.24 
 
 		 270 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4277  hypothetical protein  52.38 
 
 		 114 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2989  hypothetical protein  37.79 
 
 		 373 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  35.63 
 
 		 2816 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  32.19 
 
 		 623 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>