11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2989 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2989  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2460  hypothetical protein  61.86 
 
 		 381 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.152252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2292  hypothetical protein  48.99 
 
 		 336 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2286  hypothetical protein  38.62 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2011  hypothetical protein  41.6 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3491  hypothetical protein  60.26 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3811  hypothetical protein  43.17 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4277  hypothetical protein  52.46 
 
 		 114 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222715 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0027  hypothetical protein  54.17 
 
 		 273 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  31.36 
 
 		 2272 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3674  hypothetical protein  29.91 
 
 		 459 aa  43.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.476459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>