12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2292 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2292  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2460  hypothetical protein  44.44 
 
 		 381 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.152252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2286  hypothetical protein  50.55 
 
 		 456 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2989  hypothetical protein  45.28 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2011  hypothetical protein  40.88 
 
 		 425 aa  165  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3811  hypothetical protein  43.85 
 
 		 270 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3491  hypothetical protein  51.57 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4277  hypothetical protein  53.97 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2621  hypothetical protein  60 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.335901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  27.84 
 
 		 1088 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2920  hypothetical protein  44.83 
 
 		 762 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>