14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0027 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0027  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  546  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  28 
 
 
1056 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  47.46 
 
 
491 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3340  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  49.23 
 
 
607 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
1077 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3340  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  50 
 
 
588 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00745561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 
428 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2989  hypothetical protein  54.17 
 
 
373 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5504  hypothetical protein  54.72 
 
 
1249 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529515  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0576  hypothetical protein  52.54 
 
 
996 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  52.94 
 
 
518 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  54.9 
 
 
411 aa  42.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3011  cell wall anchor domain-containing protein  49.18 
 
 
604 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0165682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  58.49 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>