19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45854 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  100 
 
 		 1689 aa  3383    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23918  predicted protein  36.13 
 
 		 1000 aa  208  9e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160353  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01140  nucleoporin nup189, putative  24.6 
 
 		 1927 aa  152  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.444999  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42583  nuclear pore protein  31.96 
 
 		 951 aa  75.5  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43774  predicted protein  48.99 
 
 		 406 aa  75.1  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28983  predicted protein  40.89 
 
 		 1556 aa  67.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29138  predicted protein  37.74 
 
 		 766 aa  66.6  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0822603  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04670  conserved hypothetical protein  37.89 
 
 		 2094 aa  65.5  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80553  Nucleoporin NUP145 precursor (Nuclear pore protein NUP145) Contains: Nucleoporin NUP145N (N-NUP145) Nucleoporin NUP145C (C-NUP145)  38.51 
 
 		 1348 aa  65.5  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05627  Putative uncharacterized proteinSONB ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873R2]  28.03 
 
 		 1962 aa  62  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0410188 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82631  predicted protein  38.06 
 
 		 551 aa  62  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.293318 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66703  Nucleoporin NUP49/NSP49 (Nuclear pore protein NUP49/NSP49)  34.42 
 
 		 402 aa  57.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88123  Nucleoporin NSP1 (Nuclear pore protein NSP1) (Nucleoskeletal-like protein) (p110)  34.34 
 
 		 727 aa  54.7  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.26666  normal  0.354188 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06210  Pol II transcription elongation factor, putative  34.03 
 
 		 1152 aa  50.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42841  predicted protein  32.16 
 
 		 915 aa  49.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80670  nuclear pore protein  31 
 
 		 1203 aa  48.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381762  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04595  An-Nup2 Nuclear pore complex protein (Eurofung)  36.63 
 
 		 512 aa  48.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  56.45 
 
 		 1060 aa  45.8  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15396  predicted protein  43.16 
 
 		 1803 aa  45.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.407971  normal  0.0726327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>