13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43774 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43774  predicted protein  100 
 
 		 406 aa  815    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29138  predicted protein  28.67 
 
 		 766 aa  79.7  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0822603  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  40.46 
 
 		 1689 aa  67.8  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88123  Nucleoporin NSP1 (Nuclear pore protein NSP1) (Nucleoskeletal-like protein) (p110)  41.18 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.26666  normal  0.354188 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23918  predicted protein  37.77 
 
 		 1000 aa  60.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160353  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01040  hypothetical protein  24 
 
 		 581 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01140  nucleoporin nup189, putative  39.61 
 
 		 1927 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.444999  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80553  Nucleoporin NUP145 precursor (Nuclear pore protein NUP145) Contains: Nucleoporin NUP145N (N-NUP145) Nucleoporin NUP145C (C-NUP145)  35.86 
 
 		 1348 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42583  nuclear pore protein  39.38 
 
 		 951 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66703  Nucleoporin NUP49/NSP49 (Nuclear pore protein NUP49/NSP49)  35.56 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82631  predicted protein  33.92 
 
 		 551 aa  50.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.293318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2284  hypothetical protein  36.29 
 
 		 513 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.307915  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28983  predicted protein  33.72 
 
 		 1556 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>