45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28983 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_28983  predicted protein  100 
 
 
1556 aa  3131    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07726  Nuclear pore complex protein An-Sac3 (Eurofung)  28.15 
 
 
1237 aa  112  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.205414 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26211  predicted protein  29.73 
 
 
340 aa  96.3  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.730647 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43680  predicted protein  26.35 
 
 
1458 aa  85.1  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.16765  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05030  hypothetical protein  26.24 
 
 
1625 aa  82  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0868175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  29 
 
 
488 aa  68.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59295  protein involved in processes affecting the actin cytoskeleton and mitosis  25.26 
 
 
1192 aa  67  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  37.21 
 
 
334 aa  66.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23918  predicted protein  41.93 
 
 
1000 aa  65.1  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160353  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  31.52 
 
 
2196 aa  61.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  30.68 
 
 
481 aa  60.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  30.68 
 
 
478 aa  60.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0135  hypothetical protein  28.12 
 
 
293 aa  58.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00185509  normal  0.0124096 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00809  DNA-directed RNA polymerase Fragment (EC 2.7.7.6) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873Q6]  29.12 
 
 
1745 aa  57  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0591405  normal  0.0228147 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04670  conserved hypothetical protein  33.72 
 
 
2094 aa  56.2  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42841  predicted protein  33.8 
 
 
915 aa  55.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  35.48 
 
 
925 aa  55.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  37.72 
 
 
1689 aa  55.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  37.6 
 
 
332 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  52.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42583  nuclear pore protein  36.04 
 
 
951 aa  51.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  26.12 
 
 
436 aa  52  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  27.75 
 
 
440 aa  50.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  36.2 
 
 
681 aa  51.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  27.75 
 
 
440 aa  50.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  38.06 
 
 
342 aa  50.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2273  enterotoxin  36.04 
 
 
500 aa  50.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0333544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  36.8 
 
 
330 aa  50.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  35.77 
 
 
318 aa  50.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2221  hypothetical protein  24.1 
 
 
380 aa  49.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  50.63 
 
 
990 aa  49.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  37.63 
 
 
303 aa  49.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  50.63 
 
 
959 aa  49.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  33.85 
 
 
333 aa  49.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  33.85 
 
 
333 aa  49.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80670  nuclear pore protein  32.71 
 
 
1203 aa  48.9  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381762  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  49.37 
 
 
964 aa  48.9  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3465  translation initiation factor IF-2  48.75 
 
 
905 aa  48.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  40.2 
 
 
894 aa  48.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.5 
 
 
561 aa  48.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  54.88 
 
 
653 aa  47.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  23.21 
 
 
342 aa  46.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9097  hypothetical protein  33.94 
 
 
3151 aa  46.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  26.51 
 
 
474 aa  45.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04570  conserved hypothetical protein  35.38 
 
 
567 aa  45.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.375715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>